抚州市临川区第二中医院创建于1952年，最早为上顿渡联合诊所，座落在上顿渡中兴北路162号。1955年院址搬迁到中兴北路146号，院名为上顿渡卫生所，1963年定名为上顿渡镇卫生站。
1971年院址搬迁到中兴南路66号，院名为上顿渡人民公社医院，1945年院址迁移到桥东路4号定名为上顿渡卫生院，1982年成立临川县中医院，1996年县市合并后，改称临川市第二中医院，2000年临川市改为抚州市临川区，冠名为抚州市临川区第二中医院。
现临川区第二中医院座落在抚州市临川区上顿渡桥东路4号，占地面积为1320m2。建筑面积为3408.56m2。现有职工近70名，其中高级职称6人，中级职称28人，设置了骨伤科、针灸理疗科、儿科、妇产科、急诊科、外科、中西医结合内科等科室。
购置了先进的X光机、电子胃镜、B超、脑电地形图、胎儿监护仪等大型医疗设备，建立了心电工作站，开设病床40余张。2002年被评为“诚信单位”。